"Café con leche" comienza con Walter White (interpretado por Bryan Cranston) y Jesse Pinkman (interpretado por Aaron Paul) tratando de deshacerse del cuerpo de Krazy-8 (interpretado por Maximino Arciniega), un traficante de metanfetamina que habían capturado en el episodio anterior. Mientras tanto, Hank Schrader (interpretado por Dean Norris), el cuñado de Walter y un agente de la DEA, comienza a investigar una serie de pequeñas pistas relacionadas con la producción de metanfetamina en Albuquerque.